由于中方科学家另辟蹊径解决了研究瓶颈,9月23日,由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”在北京、阿姆斯特丹和纽约等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。 该项目由荷兰瓦赫宁根大学发起,2006年正式启动。中国农科院副院长屈冬玉博士作为项目发起人之一,组建了由农科院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院的专家组成的中方团队。
2006年—2008年底,国际协作组遇到了基因组高度杂合、物理图谱质量不高、测序成本高等难以克服的困难。此时,中方首席科学家黄三文博士提出了一套新的策略:以单倍体马铃薯为材料来降低基因组分析的复杂度,并采用快捷的全基因组鸟枪法策略和低成本的新一代DNA测序技术。这一策略的改变,不仅大大提高了整个联盟的进程,提前两年达到既定目标,且促使中国团队实现了从参与到主导的过程。
马铃薯基因组有12条染色体,8.4亿个碱基对。该框架图覆盖了95%以上的基因。深圳华大的新一代DNA测序技术和新的基因组拼接软件在项目中发挥了关键作用,使基因组测序的成本和时间都减少到原来的1/10。
了解马铃薯基因组序列,将帮助科学家从分子水平了解马铃薯是如何生长、发育和繁殖的,从而有助于提高马铃薯的产量、品质和抗病性,更重要的,是将加速马铃薯新品种的培育,使其原本需要10—12年的育种过程缩短至5年左右。因此,参与国际马铃薯基因组测序计划,使我国直接进入了马铃薯遗传育种研究的第一方阵,为培养具有自主知识产权的优良品种打下了坚实基础。 |
|